番茄苗期病害主要有猝倒病、立枯病两种：
猝倒病：主要症状是茎基部出现水渍状病斑，很快变成黄褐色，病部缢缩呈线状，病害发展迅速，湿度大时，成片幼苗猝倒。病苗残体表面及附近床面上长出白色絮状菌丝。
立枯病：主要症状茎基部产生褐色椭圆形病斑，发病初期白天萎蔫，晚上恢复正常，病部有轮纹，病斑渐凹陷，扩大到绕茎一周时，基部干缩，但不产生白絮状霉层，这是与猝倒病的不同之处。
