在田间生育期，植株矮化、僵直，叶片黄化，小叶向上卷曲。发病后期，茎基部变黑腐烂，植株枯死。病株所结薯块，先从匍匐茎处变黑腐烂，向内发展使心部变黑，形成黑心。在潮湿条件下，病程发展很快，导致整个薯块腐烂，并发出恶臭味。这种黑心是马铃薯黑胫病造成，由一种细菌侵染引起。发病轻的薯块，在贮存期仍可继续腐烂，并发出恶臭味。
在贮藏期，马铃薯还可产生另一种黑心，症状出现在块茎内部，外表无症状。切开块茎后，可见中心部位变黑，有的变黑部分中空，表现为失水变硬，呈革质状，但不易腐烂，无异味。如发病严重时黑心部分可延伸到芽眼部位，薯皮局部变竭并凹陷。如受细菌侵染也可发生腐烂。病因是贮运过程中，堆积过厚，通风不良，缺氧呼吸造成黑心，属生理病害。
