由于杂交稻种子与常规稻不一样，加上杂交稻本身品种之间有差异，颖壳有厚薄，密封性有好坏，芽谷黑谷有多有少，所以播种措施要因种而异。如果播种时天气较好，气温较高，建议农户浸种后直接盲谷播种。如果要催芽，则要掌握好种子发芽的三要素：水分、温度、氧气。为提高种子生活力，使之整齐发芽，健壮成苗，在种子催芽时应注意以下几点。
杂交稻种子清洗和浸种必须用干净的水，浸种时强调用“402”药剂或类似抗菌剂浸种消毒，既可有效地防止恶苗病，又可提高种子发芽率。“402”浸种不必用清水预浸，中途不坏水，浸种时间一般掌握在24小时左右，如遇室内温度25℃以上，协优系种子和有一定芽谷、开颖的其他品种则控制在24小时以内为好。如果清水浸种，对有芽谷、开谷或黑谷的种子严格控制浸种时间，并每10小时-12小时换水一次，以免有些种子萌动过程中产生毒害物质。
适宜的温度是种子发芽的关键，也是掌握难度较大的要素，温度偏低容易使浸种催芽失败，所以杂交稻种播种不提倡过早。杂交稻种子萌动的最适宜温度为20℃-33℃，低于25℃萌动缓慢，发芽日期延长，低于20℃会抑制发芽，时间过久会引起幼芽死亡。我国东南平原地区一般5月中旬开始室内温度可望通过25℃，这时浸种后种子经漂洗可直接晾在竹蒌里，上盖温湿布或毛巾，一般1天-2天就会露白发芽，催芽过程中避免直接晒太阳。山区种植单季稻往往需要采取保温催芽措施。
水长芽、气长根，二者是矛盾的统一，调节适当才能使种子正常健壮发芽，根与芽平衡生长。所以催芽过程中一般12小时可淋水一次，翻动一次。露白后种子呼吸加强，若通气不良易产生酒精中毒烧芽。催芽技术标准为芽长半粒谷。完成种子催芽后如遇天气原因不能及时播种，须将芽谷放在通风阴凉处薄摊，时间偏长可适当淋水以防干芽。
