芹菜的吸肥力弱，但其耐肥力强，一般施肥都大大超过其吸收量的2～3倍，其根系只有在土壤高浓度状态下才能够大量吸收肥料。芹菜的信用器官是营养体，其需肥量是随其生育期的增加而逐渐加大。
1、苗期施肥，芹菜可直播也可育苗移栽。因其种子发芽出苗困难，幼苗生长缓慢，苗期长，多采用育苗移栽，育苗畦施肥时，可先起出畦面表土再施入基肥。每100㎡苗床撒石灰25公斤，腐熟有机肥40公斤，复合肥15公斤，然后浅挖土12～15厘米，将肥料与土壤充分混匀，耙细、整平后即可播种。出苗后，根据天气和幼苗生长情况及时浇水，一般2～3天一次，每次必须浇透，以利长根。出苗后10天，追一次0.5%尿素，当长出3～4片真叶时，追一次2.5%过钙液，到苗高6～10厘米定植。
2、大田基肥的施用，定植地深翻 30cm ，烤晒白，每亩菜地撒石灰50公斤，再施有机肥300公斤，复合肥80～100公斤，硼砂0.5～1公斤，一次施入土中作基肥。将肥料与土壤拌和均匀，耙平畦面，开浅沟定植。
3、追肥的施用，由于芹菜根系浅，而且栽培密度大，除在定植前施足基肥外，在追肥上应勤施薄施。一般定植后的缓苗期间不追肥，缓苗后植株生长缓慢，为了促进新根和叶片的生长，可施一次提苗肥，每亩随水追肥10公斤硫酸铵。当新叶大部分展出，标志植株进入旺盛生长期，叶面积迅速扩大，叶柄迅速伸长，芹菜生长旺盛，是养分最大效率期，这时要多次追施肥料。第一次每亩施硫酸铵15～20公斤，10～15天后施有机肥300公斤，再经10～15天，可追施一次硫酸铵15～20公斤。除施用氮肥外，每亩应施磷二钾10公斤随水浇施，追肥要多用尿素，少用硝态铵氮肥，少用人粪尿以免伤根。适当增加硼砂和石灰用量。
