小麦全蚀病是一种典型的根部病害，在小麦全生育期均可发病，病菌只侵染根部和茎基部1～2节。病害的发生轻重受多种因素影响。连作重茬发病重；小麦与夏玉米一年两作多年连种，病害发生重；土壤肥力低，氮、磷、钾比例失调，尤其是缺磷地块发病重；春季多雨，土壤湿度大有利于发病。
土壤处理，小麦全蚀病发生重的地块针对性药剂与土混合并拌匀，撒于地表，然后翻耕整地播种。
药剂拌种，播种前用种衣剂和新高脂膜拌种可保温、保湿、吸胀，提高种子发芽率，使幼苗健壮。驱避地下虫害，隔离病毒感染。
药剂喷施，对于未作药剂土壤处理和拌种的病田在小麦三叶期、返青期、拔节期，用新高脂膜喷施，使药液通过麦苗渗入到植株体内，大大减轻小麦全蚀病危害程度。
